Welchen owner und group hat denn die Datei?
Ist der Perl-User denn in der Gruppe drin?

Quote

dass dieser user scheinbar kein Recht hat die Systemzeit auf der CIFS Freigabe zu ändern

Wieso muss der User die Systemzeit ändern!?

Welche Rechte hat er denn für die Freigabe? Ist die Freigabe auf einem Windows-System (nehme ich mal an)? Dann richten sich doch wohl die Möglichkeiten, was der User tun darf, nach dem Login dort.