Jetzt habe ich das Problem ja so gelöst, als dass ich nämlich meine ganze Applikation in ein Modul verlagert habe. Im Prinzip besteht die Applikation nur noch aus 3 Zeilen Code in der das Modul aufgerufen wird.
Das dürfte doch eigentlich das beste sein, oder? Weil ja die Module nicht jedesmal geklont werden müssen wie die ModPerl-Applikation.
Brauche noch eine kurze Bestätigung damit ich mich besser führe =)