Was haben denn die Trace-Ausgaben ergeben?
Am besten einmal auf der Maschine, wo es klappt und dann nochmal auf der, wo es nicht geht. Dann kann man da mal vergleichen...

Ne Pause in den SQL-Befehlen wäre für mich komisch. Für meine Begriffe darf DBI->do erst returnen, wenn das Statement fertig ist. Denke also nicht, dass es sowas ist.
Tippe immer noch auf Transaktionen, die hier nicht richtig abgeschlossen werden oder etwas in der Art...