So, nach vielem hin und her probieren, habe ich jetzt einen Workaround gefunden. Das Problem war nicht, wie erst gedacht der Server selber, sondern die Tatsache das von Catalyst alle Requests versucht werden zu beantworten, wenn man eine "default" Action definiert hat. Nachdem ich die Request die vom Javaapplet ausgehen da ins leere laufen lasse, funktioniert alles.
Warum dieses Applet der Meinung ist irgendwelche seltsamen Request abzusetzen steht natürlich auf einem ganz anderen Blatt.

Gruss, Tim