unter Linux: LF
unter Win: CR + LF

und auf dem jeweiligen System ist \n das obige.

D.h. wenn du eine Textdatei mit dem Linuxzeilentrenner hast, kannst du diese unter Linux mit deinem obigen Beispiel ohne Probleme Zeilenweise einlesen.
Selbst unter Windows klappt es bei mir Problemlos eine Linuxdatei Zeilenweise einzulesen.

Dein Problem ist, dass du explizit eine Leerzeile im Code eingefügt hast:
print "job $_\n";

Da ist es kein Wunder, dass du eine Leere Zeile hast wenn du ein Newline schreibst.