"funktioniert nicht" ist keine Fehlerbeschreibung? Was passiert? Welche Fehlermeldung taucht auf?

Wenn die PDFs im cgi-bin-Verzeichnis liegen, kannst Du sie von dort nicht einfach so runterladen. Das Verzeichnis soll doch CGIs enthalten, also wird versucht, das PDF als CGI auszuführen.
Entweder legst Du die CGIs in einem anderen Ordner unter htdocs ab, auf dem keine "Option +ExecCGI" wirkt, oder Du musst ein CGI-Skript schreiben, dass den Download bereitstellt (also Datei lesen und ausgeben)...