Kurze Antwort: Benutze Perl. Was hast du erwartet? Das hier ist ein Perlforum :-)

Das Thema ist ansonsten recht Komplex. Du hast schon ganz richtig erkannt, dass viele Projekte auf PHP setzen. Meiner Meinung nach ist aber PHP komplexen Programmieraufgaben weniger gut gewachsen als Perl. Wenn man sich Perl anschaut, merkt man schon, dass von Anfang an besser geplant und designet wurde. Schau dir einfach nur mal an, wie viele verschiedene Funktionen standardmäßig den PHP-Namensraum zuspammen und wie wenige bei Perl. Trotzdem kann man mit Perl viele Aufgaben mit weniger Aufwand lösen, weil die Funktionen flexibler sind.

Ein weiteres - wenn nicht sogar das - Argument für Perl ist das CPAN. Vergleiche mal die Anzahl der Module im CPAN mit denen in PEAR.